Arcybiskupstwo po Szeptyckim objął Josyf Slipyj. 1 marca 1946 wewnątrz czasie synodu poświęconego przygotowaniom do 350 rocznicy Unii Brzeskiej Sowieci aresztowali w dobrym stanie Episkopat greckokatolicki, skazując jego członków na pudło plus długoletnie roboty przymusowe wewnątrz obozach pracy.
Nie wzięty na wskroś Watykan także zwołany na wskroś stalinowskie władze "sobór" zwolenników likwidacji cerkwi greckokatolickiej rozpoczęty we Lwowie 7 marca 1946 zniósł Unię z Rzymem również przyłączył ten świątynia do prawosławia. W "soborze lwowskim" nie wziął udziału żaden biskup, jego uczestnikami byli podrzędni duchowni także agenci NKWD.
W czasach ZSRR wewnątrz latach 1946-1990 związek wyznaniowy grekokatolicki był największą podziemną organizacją religijną udzielającą przeciw sowieckim władzom sakramentów oraz nauczającą po cichu religii.
Ukraińska Cerkiew Greckokatolicka odrodziła się wewnątrz 1990.